Έτος 2045. Η Μότοκο Κουσανάγκι κι ο Τομέας 9 επιστρέφουν για ν' αντιμετωπίσουν μια νέα απειλή σε μια ταινία μεγάλου μήκους, βασισμένη στην πρώτη σεζόν του "SAC_2045"....

Ένα ρομπότ πρέπει να προστατεύει την ύπαρξή του εφόσον αυτή η προστασία δεν βλάπτει ένα ανθρώπινο ον. Η ταινία είναι βασισμένη στο manga του Masamune Shirow και σκηνοθετημένη από τον Oshii Mamoru. Η Ταγματάρχης Kusanagi Motoko έχει εγκαταλείψει το φυσικό της σώμα και είναι πλέον ένα «πνεύμα» το οποίο ζει στο δίκτυο. Αυτό έχει σαν αποτέλεσμα ο Batou, να γίνει πλέον ο ανώτερος αξιωματούχος του...

Μία ανδροιδες αστυνομικός και ο συνεργάτης της κυνηγούν ένα πανίσχυρο χάκερ που αυτοαποκαλείται Puppet Master....