Ο Έντουαρντ Λάιονχαρτ γελοιοποιείται την νύχτα απονομής βραβείων μιας ένωσης κριτικών. Νομίζοντας τον εαυτό του μεγάλο Σαιξπηρικό ηθοποιό, ενώ είναι στην πραγματικότητα ατάλαντος και εγωμανής, κάνει απόπειρα αυτοκτονίας από το μπαλκόνι του διαμερίσματος συνεδριάσεων των κριτικών πηδώντας στον Τάμεση. Το σώμα του δεν ανακαλύπτεται. Μερικά χρόνια αργότερα, οι κριτικοί αρχίζουν να δολοφονούνται με...

Η ζωή στην πόλη Olympus κυλάει κανονικά μετά τα γεγονότα στην πρώτη ταινία Appleseed (2004) με την Deunan και τον Briareos να είναι μέλη της ομάδας E.S.W.A.T. Ώσπου μια μέρα συμβαίνει ένα περιστατικό με ομήρους κάποιους διπλωμάτες και μετά την επέμβαση ξεκαθαρίζετε ότι οι "τρομοκράτες" δεν ήταν παρά cyborgs, κάτι που κάνει τεράστια διαφορά μιας και μέχρι τώρα σε κάθε τέτοιο περιστατικό υπάρχουν...