Η Konoha δέχεται ξαφνική επίθεση από μία μυστηριώδης ομάδα ninja, αφήνοντάς τη για άλλη μία φορά στην ιστορία της κατεστραμμένη. Αυτό το συμβάν ίσως να επαναλάβει τον τραγικό πόλεμο των ninja που ξέσπασε πολλά χρόνια πριν. Στο μεταξύ, ο Naruto καταβάλλοντας προσπάθειες για την αποκατάσταση του χωριού, συναντάει τον Sasuke σε μία άγνωστη περιοχή μαθαίνοντας πως έχει εναντιωθεί σε αυτήν την επίθεση…...