Ακολουθώντας τα γεγονότα των Troopers Starship: Invasion, ο στρατηγός Johnny Rico τοποθετείται σε μια απομονωμένη βάση στον Άρη μαζί με μια ομάδα νεοσύλλεκτων. Η Ομοσπονδία Terran σχεδιάζει μια επίθεση στον πλανήτη των εντόμων, αλλά ο Άρης σύντομα γίνεται στόχος μιας επικείμενης επίθεσης των εντόμων. Τώρα είναι στην ευθύνη του Rico και των συναδέλφους του συμπεριλαμβανομένης της Isabelle "Dizzy"...
Σε μια ουτοπική κοινωνία που δημιουργήθηκε στο τέλος του τρίτου παγκόσμιου πολέμου, μια γυναίκα πολεμίστρια που έχει ανασυρθεί από τoυς ερημότοπους αρχίζει να βλέπει ρωγμές σε αυτή τη νέα πρόσοψη. Και τι έχει σχεδιάσει αυτή η κοινότητα για την υπόλοιπη ανθρωπότητα;...
Έτος 2045. Η Μότοκο Κουσανάγκι κι ο Τομέας 9 επιστρέφουν για ν' αντιμετωπίσουν μια νέα απειλή σε μια ταινία μεγάλου μήκους, βασισμένη στην πρώτη σεζόν του "SAC_2045"....
Η ζωή στην πόλη Olympus κυλάει κανονικά μετά τα γεγονότα στην πρώτη ταινία Appleseed (2004) με την Deunan και τον Briareos να είναι μέλη της ομάδας E.S.W.A.T. Ώσπου μια μέρα συμβαίνει ένα περιστατικό με ομήρους κάποιους διπλωμάτες και μετά την επέμβαση ξεκαθαρίζετε ότι οι "τρομοκράτες" δεν ήταν παρά cyborgs, κάτι που κάνει τεράστια διαφορά μιας και μέχρι τώρα σε κάθε τέτοιο περιστατικό υπάρχουν...
Μια νεαρή γυναίκα στρατιώτης η Ντιούναν και ο σύντροφός της,ο Μπριάρεος, μια ανθρωπομηχανή επιβιώνοντας μετά από τον αποκαλυπτικό παγκόσμιο πόλεμο της Νέας Υόρκη, αναζητούν τη μελλοντική ελπίδα του ανθρώπου, τη θρυλική πόλη του Ολύμπου....